Η εκτέλεση μιας επαναφοράς εργοστασιακών ρυθμίσεων, που αναφέρεται επίσης ως επαναφορά των Windows ή επαναδιαμόρφωση και επανεγκατάσταση, θα καταστρέψει όλα τα δεδομένα που είναι αποθηκευμένα στον σκληρό δίσκο του υπολογιστή και όλους τους ιούς εκτός από τους πιο περίπλοκους ιούς. Οι ιοί δεν μπορούν να βλάψουν τον ίδιο τον υπολογιστή και οι επαναφορές εργοστασιακών ρυθμίσεων ξεκαθαρίζουν πού κρύβονται οι ιοί.