Όχι από το ίδιο το Safari, αλλά είναι δυνατό να μολυνθεί το iPhone σας μέσω του Safari. Όπως κάθε άλλο πρόγραμμα περιήγησης, το Safari μπορεί να είναι μια απόδραση για κακόβουλα προγράμματα και ιούς. Αυτός είναι ο λόγος για τον οποίο είναι σημαντικό να αποφεύγετε να κάνετε κλικ σε συνδέσμους και διαφημίσεις σε ιστότοπους που δεν εμπιστεύεστε και γενικά να αποφεύγετε ιστότοπους με ύποπτη εμφάνιση.